经省委《关于省政协机关机构改革方案》和《苏编[2003]3号》、《苏编[2005]5号》文件批准，省政协机关设办公厅、研究室，10个专门委员会。

    １、省政协办公厅
    内设7个职能处室：秘书处、人事处、行政处、接待处、联络处、网络技术处、长江路292号大院管理处。

   ２、省政协研究室
    内设2个职能处室：综合处、宣传信息处。

    ３、省政协10个专门委员会及办公室
    提案委员会及其办公室、学习委员会及其办公室、文史委员会及其办公室、经济委员会及其办公室、科学技术委员会及其办公室、教育文化委员会及其办公室、医卫体育委员会及其办公室、人口资源环境委员会及其办公室、社会法制（民族宗教）委员会及其办公室、港澳台侨（外事）委员会及其办公室 。

    另设：机关党委、纪律检查组。老干部处、联谊俱乐部(事业)、南京中国近代史遗址博物馆管理建设办公室（事业)。
 

  （2009年6月）