分析：港口岸线是港口的核心宝贵资源，但在目前管理中存在的问题是：1、无偿使用，不能体现宝贵资源价值；2、岸线使用许可程序不明确，各地许可方式不一，不利于有限资源的统一管理；3、未建立利用与回收机制，不利于发挥资源作用，政府对资源的主控权削弱等。除此之外，《港口法》及交通部5号公告对港口岸线使用只作了原则性规定，行政许可的要件不全，在实际工作中难以操作，建议制定地方性法规加以规定。

    建议：制定《江苏省港口岸线管理办法》，主要确立岸线管理以下几方面的制度：

    (一)确立港口浅、深水岸线使用许可程序，包括浅、深水岸线的定义，使用港口岸线许可条件、申请所需提交的资料、办理许可的期限等，并理顺岸线使用申请与立项、土地利用审批之间的顺序关系。   

    (二)确立《港口岸线使用证》制度，注明使用权人、岸线长度、使用年限等，便于加强岸线管理；并且企业以港口岸线、码头作为贷款抵押时，可向港口行政管理部门申请在《港口岸线使用证》上加以备注，解决港口设施贷款无法登记、企业贷款难问题。

    (三)确立港口岸线有偿使用制度。港口岸线是宝贵资源、稀缺资源，优良的港口岸线将为企业带来巨大的经济效益，应改变现行无偿使用的状况，实行有偿使用，采用一次性缴纳占用费或分年度支付占用费的方式，体现岸线价值，提高企业占用岸线门槛。

    (四)确立地主港开发模式。在地方财力允许范围之内，鼓励地方政府为主体开发岸线、建设码头，以租赁等方式由企业经营，解决现有港口岸线大量出让所带来的经济隐患、国防安全隐患，提高政府掌控资源能力与手段。